サッカー ウェア同様に両リーグをまとめる組織として「日本プロフェッショナル野球組織」が2007年度まで存在した。 2004年のプロ野球再編問題で論点とされた責任所在や事態収拾などの不手際を契機に、2008年度から「組織」は社団法人である「機構」の内部組織とされた。森保一、西岡明彦『ぽいち 森保一自伝-雑草魂を胸に』フロムワン、2004年2月1日。 Nippon サッカー ジャージ Professional Baseball」を共有し、「組織」は競技や選手契約に関わる規則を「機構」は興行をそれぞれ分担する一方、「組織」のコミッショナーが「機構」の会長を兼任するなど両者の関係は曖昧だった。
